表1 菌名编码 |
编码 |
菌名 |
|
1100 |
Staphylococcus spp |
葡萄球菌属 |
1101 |
Staphylococcus aureus |
金黄色葡萄球菌 |
1102 |
staphylococcus auricularis |
耳葡萄球菌 |
1103 |
staphylococcus capitis |
头状葡萄球菌 |
1104 |
staphylococcus cohnii |
孔氏葡萄球菌 |
1105 |
staphylococcus epicermidis |
表皮葡萄球菌 |
1106 |
staphylococcus heamolyticus |
溶血葡萄球菌 |
1107 |
staphylococcus hominis |
人葡萄球菌 |
1108 |
staphylococcus hyicus |
猪葡萄球菌 |
1109 |
staphylococcus intermedius |
中间葡萄球菌 |
1110 |
staphylococcus lentus |
缓慢葡萄球菌 |
1111 |
staphylococcus saprophyticus |
腐生葡萄球菌 |
1112 |
staphylococcus schleiferi? |
施氏葡萄球菌 |
1113 |
staphylococcus simulans |
模仿葡萄球菌 |
1114 |
staphylococcus warneri |
华纳葡萄球菌 |
1115 |
staphylococcus xylosus |
木糖葡萄球菌 |
1116 |
Staphylococcus? lugdunensis |
里昂葡萄球菌 |
1117 |
Staphylococcus saccharolyticus |
解糖葡萄球菌 |
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1200 |
Streptococcus spp |
链球菌属某种 |
1201 |
Streptococcus acidominimus |
少酸链球菌 |
1202 |
Streptococcus aglactiae(Group B) |
无乳链球菌 |
1203 |
Streptococcus anginosus |
咽颊炎链球菌 |
1204 |
Streptococcus bovis |
牛链球菌 |
1205 |
Streptococcus constellatus |
星座链球菌 |
1206 |
Streptococcus dysgalactiae |
停乳链球菌 |
1207 |
Streptococcus equi(Group C/G) |
马链球菌 |
1208 |
Streptococcus equinus(Group D) |
马肠链球菌 |
1209 |
Streptococcus intermedius |
中间链球菌 |
1210 |
Streptococcus mitis |
缓症链球菌 |
1211 |
Streptococcus mutans |
变异链球菌 |
1212 |
Streptococcus pneumoniae |
肺炎链球菌 |
1213 |
Streptococcus pyogenes(Group A) |
化脓性链球菌 |
1214 |
S.treptococcus zooepidemicus(GroupC) |
兽瘟链球菌 |
1215 |
Streptococcus sanguis |
血液链球菌 |
1216 |
Streptococcus viridans |
草绿色链球菌(a型溶血链球菌) |
1217 |
Group A streptococcus |
A群链球菌 |
1218 |
Group B streptococcus |
B群链球菌 |
1219 |
Group C streptococcus |
C群链球菌 |
1220 |
Group G streptococcus |
G群链球菌 |
1221 |
Group D enterococcus |
D群肠球菌 |
1222 |
Group D nonenterococcus |
D群非肠球菌 |
1223 |
Streptococcus groupA,C,F,G |
A,C,F,G群链球菌(B型溶血链球菌) |
1224 |
Enterrococcus avium |
鸟肠球菌 |
1225 |
Enterococcus casseliflavus |
酪黄肠球菌 |
1226 |
Enterococcus durans |
坚韧肠球菌 |
1227 |
Enterococcus faecalis |
粪肠球菌 |
1228 |
Enterococcus faecium |
屎肠球菌 |
1229 |
Enterococcus gallinarum |
鸡鹑肠球菌 |
1230 |
Enterococcus hirae |
空肠肠球菌 |
1231 |
Streptococcus group F |
F群链球菌(B型溶血链球菌) |
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1300 |
Corynebacterium spp |
棒状杆菌属 |
1301 |
Corynebacterium diphtheriae |
白喉棒状杆菌 |
1302 |
Corynebacterium diphtheriae subsp.gravis |
棒状杆菌重型亚种 |
1303 |
Corynebacterium diphtheriae subsp.mitis |
棒状杆菌轻型亚种 |
1304 |
Corynebacterium diphtheriae subsp.intermedius |
棒状杆菌中间型亚种 |
1305 |
Corynebacterium pseudotuberculosis |
假结核棒状杆菌 |
1306 |
Corynebacterium xerosis |
干燥棒状杆菌 |
1307 |
Corynebacterium pseudodi phtheriae |
假白喉棒状杆菌 |
1308 |
Corynebacterium bovis |
牛棒状杆菌 |
1309 |
Corynebacterium seminale |
生殖棒状杆菌 |
1310 |
Corynebacterium jeikeium |
杰氏棒状杆菌 |
1311 |
Corynebacterium minutissimum |
极小棒状杆菌 |
1312 |
Corynebacterium striatum |
纹带棒状杆菌 |
1313 |
Corynebacterium ulcerrans |
溃疡棒状杆菌 |
1314 |
Corynebacterium urealuticum |
解脲棒状杆菌 |
1315 |
Corynebacterium GroupJK |
JK群棒状杆菌 |
1316 |
Dermabacter hominis |
人皮肤棒状杆菌 |
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1400 |
Rhosococcus spp |
红球菌属某种 |
1401 |
Rhodococcus equi |
马红球菌 |
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1410 |
Gemella spp. |
孪生球菌属 |
1411 |
Gemella haemolysans |
溶血孪生球菌 |
1412 |
Gemella morbillorum |
麻疹孪生球菌 |
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1500 |
Listera spp |
李斯特菌属某种 |
1501 |
Listeria ivanovii |
伊凡诺夫李斯特菌 |
1502 |
Listeria monocytogenes |
产单核细胞李斯特菌 |
1503 |
Listera innocua |
无害李斯特菌 |
1504 |
Listera grayi |
格氏李斯特菌 |
1505 |
Listera seeligeri |
西利坚李斯特菌 |
1506 |
Listera welshimeri |
威尔逊李斯特菌 |
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1600 |
Erysipelothrix spp |
丹毒丝菌属 |
1601 |
Erysipelothrix rhusiopathiae |
红斑丹毒丝菌 |
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1700 |
Nocardia spp |
奴卡菌某属 |
1701 |
Nocardia asteroides |
星型奴卡菌 |
1702 |
Nocardia farcinica |
鼻疽奴卡菌 |
1703 |
Nocardia brasiliensis |
巴西奴卡菌 |
1704 |
Nocardia otitidiscaviarum |
豚鼠耳炎奴卡菌 |
1705 |
Nocardia brevicatena |
短链奴卡菌 |
? |
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1800 |
Actinomyces spp |
纽氏放线菌属某种 |
1801 |
Actinomyces pyogenes(Arcanobacterium pyogenes) |
化脓放线菌(化脓隐秘杆菌) |
1802 |
Actinomyces neui ssp anitratus |
纽氏放线菌无硝亚种 |
1803 |
Actinomyces neui ssp neus |
纽氏放线菌纽亚种 |
1804 |
Actinomyces bernardiae |
伯尔德放线菌 |
1805 |
Arcanobacterium haemolyticum |
溶血隐秘杆菌 |
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1900 |
Bacillus spp |
芽孢杆菌属某种 |
1901 |
Bacillus anthracis |
炭疽芽孢杆菌 |
1902 |
Bacillus brevis |
短芽孢杆菌 |
1903 |
Bacillus cereus |
蜡状芽孢杆菌 |
1904 |
Bacillus circulans |
环状芽孢杆菌 |
1905 |
Bacillus licheniformis |
地衣芽孢杆菌 |
1906 |
Bacillus megaterium |
巨大芽孢杆菌 |
1907 |
Bacillus pumilus |
短小芽孢杆菌 |
? |
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2000 |
Enterobacteriaceae |
肠杆菌科 |
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2010 |
Citrobacter spp |
枸橼酸杆菌属某种 |
2011 |
Citrobacter amalonaticus |
丙二酸盐阴性枸橼酸杆菌 |
2012 |
Citrobacter farmeri |
法摩枸橼酸杆菌 |
2013 |
Citrobacter braakii |
布拉格枸橼酸杆菌 |
2014 |
Citrobacter freundii |
弗劳地枸橼酸杆菌 |
2015 |
Citrobacter youngae |
杨格枸橼酸杆菌 |
2016 |
Citrobacter werkmanii |
乌克曼枸橼酸杆菌 |
2017 |
Citrobacter diversus |
异型枸橼酸杆菌 |
2018 |
Citrobacter koseri |
克氏枸橼酸杆菌 |
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2020 |
Wdwardsiella spp |
爱德华菌属某种 |
2021 |
Wdwardsiella tarda |
迟缓爱德华菌 |
2022 |
Wdwardsiella hoshinae |
保科爱德华菌 |
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2030 |
Enterobacter spp |
肠杆菌属某种 |
2031 |
Enterobacter aerogenes |
产气肠杆菌 |
2032 |
Enterobacter amnigenus |
河生肠杆菌 |
2033 |
Enterobacter asburiae |
阿斯布肠杆菌 |
2034 |
Enterobacter cloacae |
阴沟肠杆菌 |
2035 |
Enterobacter sakazakii |
阪崎肠杆菌 |
2036 |
Enterobacter gergoviae |
格高菲肠杆菌 |
2037 |
Enterobacter hormaechchei |
霍米奇肠杆菌 |
2038 |
Enterobacter intermedium |
中间肠杆菌 |
2039 |
Enterobacter agglomerans |
聚团肠杆菌 |
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2040 |
Escherichia spp |
埃希菌属某种 |
2041 |
Escherichia coli |
大肠埃希菌 |
2042 |
Escherichia coli O157 |
O157大肠埃希菌 |
2043 |
Escherichia fergusonii |
弗格森氏大肠埃希菌 |
2044 |
Escherichia hermannii |
赫尔曼氏大肠埃希菌 |
2045 |
Escherichia vulneris |
伤口大肠埃希菌 |
2046 |
Escherichia? |
侵袭性大肠埃希菌 |
2047 |
Escherichia coli Group AD |
AD群大肠埃希菌 |
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2051 |
Hafnia alvei |
蜂房哈夫尼亚菌 |
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2060 |
Klebsiella spp |
克雷伯菌属某种 |
2061 |
Klebsiella ornithinolytica |
解鸟氨酸克雷伯菌 |
2062 |
Klebsiella? ozytoca |
产酸克雷伯菌 |
2063 |
Klebsiella pneumoniae |
肺炎克雷伯菌 |
2064 |
Klebsiella rhinoscleromatis |
鼻硬结克雷伯菌 |
2065 |
Klebsiella terrigena |
土生结克雷伯菌 |
2066 |
Klebsiella planticola |
植物生克雷伯菌 |
2067 |
Klebsiella ozaenae |
臭鼻克雷伯菌 |
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2070 |
Morganella spp. |
摩根菌属 |
2071 |
Morganella morganii biogroup 1 |
摩根摩根菌生物1群 |
2072 |
Morganella morganii sibonii 1 type |
摩根摩根菌西伯尼1型 |
2073 |
Morganella morganii |
摩根摩根菌 |
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2080 |
Prpteus spp |
变形杆菌属某种 |
2081 |
Prpteus mirabilis |
奇异变形杆菌 |
2082 |
Prpteus vulgaris |
普通变形杆菌 |
2083 |
Prpteus penneri |
潘尼变形杆菌 |
2090 |
Providencia spp |
普罗威登菌属某种 |
2091 |
Providencia alcalifaciens |
产碱普罗威登菌 |
2092 |
Providencia rettgeri |
雷极普罗威登菌 |
2093 |
Providencia stuartii |
斯图普罗威登菌 |
2094 |
Providencia rustigianii |
拉氏普罗威登菌 |
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2100 |
Salmonella spp |
沙门菌属某种 |
2101 |
Salmonella dublin |
都柏林沙门菌 |
2102 |
Salmonella choleraesuis |
猪霍乱沙门菌 |
2103 |
Salmonella paratyphi A |
甲型副伤寒沙门菌 |
2104 |
Salmonella paratyphi B |
乙型副伤寒沙门菌 |
2105 |
Salmonella derby |
德尔比沙门菌 |
2106 |
Salmonella typhi |
伤寒沙门菌 |
2107 |
Salmonella enteritidis |
肠炎沙门菌 |
2108 |
Salmonella bovis morbificans |
病牛沙门菌 |
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2110 |
Serratia spp. |
沙雷菌属某种 |
2111 |
Serratia ficaria |
无花果沙雷菌 |
2112 |
Serratia liquefaciens |
液化沙雷菌 |
2113 |
Serratia fonticola |
泉居沙雷菌 |
2114 |
Serratia rubidaea |
深红沙雷菌 |
2115 |
Serratia plymuthica |
普城沙雷菌 |
2116 |
Serratia odorifera |
芳香沙雷菌 |
2117 |
Serratia marcescens |
粘质沙雷菌 |
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2120 |
Shigella spp |
志贺菌属某种 |
2121 |
Shigella boydii |
鲍氏志贺菌? |
2122 |
Shigella dysenteriae |
痢疾志贺菌 |
2123 |
Shigella flexneri |
福氏志贺菌 |
2124 |
Shigella snnei |
宋内志贺菌 |
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2130 |
Yersinia spp |
耶尔森菌属某种 |
2131 |
Yersinia enteroxolitica |
小肠结肠炎耶尔森菌 |
2132 |
Yersinia pseudotuberculosis |
假结核耶尔森菌 |
2133 |
Yersinia fredericksenii |
弗氏耶尔森菌 |
2134 |
Yersinia intermedia |
中间耶尔森菌 |
2135 |
Yersinia kristensenii |
克氏耶尔森菌 |
2136 |
Yersinia ruckeri |
鲁氏耶尔森菌 |
2137 |
Yersinia pestis |
鼠疫耶尔森菌 |
2140 |
Kluyvera |
克鲁沃菌属 |
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3000 |
Non fermenters G-b |
非发酵G-b |
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3100 |
Acinetobacter spp |
不动杆菌属某种 |
3101 |
Acinetobacter bauamnnii |
鲍曼不动杆菌 |
3102 |
Acinetobacter calcoaceticus |
醋酸钙不动杆菌 |
3103 |
Acinetobacter haemolyticus |
溶血不动杆菌 |
3104 |
Acinetobacter johnsonii |
约翰不动杆菌 |
3105 |
Acinetobacter junii |
琼氏不动杆菌 |
3106 |
Acinetobacter lwoffii |
洛菲不动杆菌 |
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3200 |
Alcaligenes spp |
产碱菌杆属某种 |
3201 |
Alcaligenes faecalis |
粪产碱杆菌 |
3202 |
Alcaligenes xylosoxidans suhsp.xylosoxidans |
木糖氧化产碱杆菌木糖亚种 |
3203 |
Alcaligenes xylosoxidans subsp. denitrificans |
木糖氧化产碱杆菌反消化亚种 |
3204 |
Alcaligenes odorans |
芳香产碱杆菌 |
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3300 |
Burkholderia spp |
伯克霍德菌某种 |
3301 |
Burkholderia cepacia |
洋葱伯克霍德菌 |
3302 |
Burkholderia gladioli |
唐昌蒲伯克霍德菌 |
3303 |
Burkholderia mallei |
鼻疽伯克霍德菌 |
3304 |
Burkholderia pickettii |
皮氏伯克霍德菌 |
3305 |
Burkholderia pseudomallei |
假鼻疽伯克霍德菌 |
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3400 |
Comamonas spp |
丛毛单胞菌属某种 |
3401 |
Comamonas acidovorans |
食酸丛毛单胞菌 |
3402 |
Comamonas testosteroni |
睾丸酮丛毛单胞菌 |
|
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3500 |
Chromobacterium (Flavobactrium)spp |
黄杆菌属某种 |
3501 |
Chromobacterium meningosepticum(Flavobactrium) |
脑膜败血性黄杆菌 |
3502 |
Chromobacterium odoratum(Flavobactrium) |
芳香黄杆菌 |
3503 |
Chromobacterium indologenes(Flavobactrium) |
产吲哚黄杆菌 |
3504 |
Chromobacterium group II b(Flavobactrium) |
II b 群黄杆菌 |
3505 |
Flavimonas oryzihabitans |
栖稻黄单胞菌 |
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3600 |
Moraxella spp |
莫拉菌属某种 |
3601 |
Moraxella atlantae |
亚特兰大莫拉菌 |
3602 |
Moraxella lacunata |
腔隙莫拉菌 |
3603 |
Moraxella osloensis |
奥斯陆莫拉菌 |
3604 |
Moraxella phenylpyruvica |
苯丙酮酸莫拉菌 |
3605 |
Moraxella nonliquefaciens |
非液化莫拉菌 |
? |
|
|
3700 |
Pseudomonas spp |
假单胞菌属某种 |
3701 |
Pseudomonas aeruginosa |
绿脓假单胞菌 |
3702 |
Pseudomonas alcaligenes |
产碱假单胞菌 |
3703 |
Pseudomonas fluorescens |
荧光假单胞菌 |
3704 |
Pseudomonas mendocina |
门多萨假单胞菌 |
3705 |
Pseudomonas sputira |
恶臭假单胞菌 |
3706 |
Pseudomonas stutzeri |
施氏假单胞菌 |
3707 |
Pseudomonas pseudoalcaligenes |
假产碱假单胞菌 |
3801 |
Stenotrophomonas maltophilia |
嗜麦芽窄食单胞菌 |
3901 |
Shewanella putrefaciens |
腐败谢瓦纳拉菌 |
|
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|
4000 |
Vibrionaeae |
弧菌科 |
4100 |
Aeromonas spp |
气单胞菌属某种 |
4101 |
Aeromonas caviae |
豚鼠气单胞菌 |
4102 |
Aeromonas hydrophila |
嗜水气单胞菌 |
4103 |
Aeromonas sobria |
温和气单胞菌 |
4104 |
Aeromonas salmonicida |
杀蛙气单胞菌 |
4105 |
Aeromonas schubertii |
舒伯特气单胞菌 |
4106 |
Aeromonas media |
中间气单胞菌 |
4107 |
Aeromonas veronii |
威隆气单胞菌 |
|
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4200 |
Plesiomonas spp |
邻单胞菌属某种 |
4201 |
Plesiomonas shigelloides |
类志贺邻单胞菌 |
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4300 |
Vibrio spp |
弧菌属某种 |
4301 |
Vibrio cholerae Group O1 |
O1群霍乱弧菌 |
4302 |
Vibrio cholerae non-Group O1 |
非O1群霍乱弧菌 |
4303 |
Vibrio cholerae Group O139 |
O139霍乱弧菌 |
4304 |
Vibrio parahaemolyticus |
副溶血弧菌 |
4305 |
Vibrio vulnificus |
致伤弧菌 |
4306 |
Vibrio fluvialis |
河弧菌 |
4307 |
Vibrio metschnikovii |
梅氏弧菌 |
4308 |
Vibrio hollisae |
霍利斯弧菌 |
4309 |
Vibrio damsela |
海鱼弧菌 |
4310 |
Vibrio alginolyticus |
溶藻弧菌 |
4311 |
Vibrio mimicus |
拟态弧菌 |
4312 |
Vibrio furnissii |
弗尼斯弧菌 |
|
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5100 |
Chromobacterium? spp |
色杆菌属某种 |
5101 |
Chromobacterium violaceum |
紫色色杆菌 |
|
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5200 |
Pasteurella spp |
巴斯德菌属某种 |
5201 |
Pasteurella multocida |
多杀巴斯德菌 |
5202 |
Pasteurella haemolytica |
溶血巴斯德菌 |
5203 |
Pasteurella pneumotropica |
侵肺巴斯德菌 |
5204 |
Pasteurella aerogenes |
产气巴斯德菌 |
5205 |
Pasteurella ureae |
尿素巴斯德菌 |
5206 |
Pasteurella gallinarum |
鸡巴斯德菌 |
5207 |
Pasteurella canis |
犬巴斯德菌 |
5208 |
Pasteurella bettyae |
贝氏巴斯德菌 |
5209 |
Pasteurella dagmatis |
达可马巴斯德菌 |
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|
5300 |
Haemophilus spp |
嗜血杆菌属某种 |
5301 |
Haemophilus parainfluenzae |
副流感嗜血杆菌 |
5302 |
Haemophilus influenzae |
流感嗜血杆菌 |
5303 |
Haemophilus haemolyticus |
溶血嗜血杆菌 |
5304 |
Haemophilus parahaemolyticus |
副溶血嗜血杆菌 |
5305 |
Haemophilus aphrophilus |
嗜沫嗜血杆菌 |
5306 |
Haemophilus paraphrophilus |
副嗜沫嗜血杆菌 |
5307 |
Haemophilus ducrehi |
杜克雷嗜血杆菌 |
5308 |
Haemophilus aegytius |
埃及嗜血杆菌 |
|
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5400 |
Capnocytophaga spp. |
二氧化碳嗜纤维菌某种 |
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5501 |
Cardiobacterium hominis |
人心杆菌 |
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5601 |
Eikenella corrodens |
腐蚀艾肯菌 |
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5701 |
Kingella app. |
金氏菌属某种 |
|
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6100 |
Neisseria spp |
奈瑟菌属某种 |
6101 |
Neisseria gonorrhoeae |
淋病奈瑟菌 |
6102 |
Neisseria meningitidis |
脑膜炎奈瑟菌 |
6103 |
Neisseria lactamica |
嗜乳糖奈瑟菌 |
6104 |
Neisseria polysaccharea |
多糖奈瑟菌 |
6105 |
Neisseria mucosa |
粘膜奈瑟菌 |
6106 |
Neisseria sicca |
干燥奈瑟菌 |
6107 |
Neisseria subflava |
浅黄奈瑟菌 |
6108 |
Neisseria cinerea |
灰色奈瑟菌 |
6109 |
Neisseria flavescens |
金黄色奈瑟菌 |
|
|
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6200 |
Moraxella spp(Branhamella catarrhalis) |
布兰汉菌属某种 |
6201 |
Moraxella catarrhalis(Branhamella catarrhalis) |
卡他布兰汉菌 |
|
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6300 |
Micrococcus spp |
微球菌属某种 |
6301 |
Micrococcus luteus |
藤黄微球菌 |
6302 |
Micrococcus varians |
易变微球菌 |
6303 |
Micrococcus roseus |
玫瑰色微球菌 |
6304 |
Micrococcus kristinae |
克里斯汀微球菌 |
|
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6400 |
Gemella spp |
孪生球菌属某种 |
6401 |
Gemella haemolysans |
溶血孪生球菌 |
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6500 |
Aerococcus spp |
气球菌属某种 |
6501 |
Aerococcus viridans |
绿色气球菌 |
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6600 |
Leuconostoc spp |
无色藻菌属某种 |
|
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6700 |
Pediococcus spp |
平面球菌属某种 |
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6801 |
Clostridium difficile |
难辩芽孢梭菌 |
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6900 |
Mycobacterium spp.(fast growth) |
分枝杆菌属某种(快生长) |
6901 |
Mycobacterium (except TB) |
非结核分枝杆菌 |
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9000 |
Fungus |
真菌 |
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9100 |
Candida spp |
假丝酵母菌属(念珠菌属)某种 |
9101 |
Candida albicans |
白色假丝酵母菌 |
9102 |
Candida famate |
无名假丝酵母菌 |
9103 |
Candida rugosa |
皱褶假丝酵母菌 |
9104 |
Candida guilliermondii |
季也蒙假丝酵母菌属 |
9105 |
Candida krusei |
克柔假丝酵母菌属 |
9106 |
Candida lusitaniae |
葡萄牙假丝酵母菌 |
9107 |
Candida parapsilosis |
近平滑假丝酵母菌 |
9108 |
Candida tropicalis |
热带假丝酵母菌 |
9109 |
Candida stella |
类星形假丝酵母菌 |
9110 |
Candida pseudotropical |
伪热带假丝酵母菌 |
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9200 |
Cryptococcus spp |
隐球菌属某种 |
9201 |
Cryptococcus albidus |
白色隐球菌 |
9202 |
Cryptococcus laurentii |
罗伦隐球菌 |
9203 |
Cryptococcus neoformans |
新型隐球菌 |
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9301 |
Torulopsis glabrata |
光滑球拟酵母菌 |
9302 |
Torulopsis candida |
念珠球拟酵母菌 |