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[转帖]如何完善凝胶图片

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顶风 发表于 2008-9-12 11:48 | 显示全部楼层 |阅读模式

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如何完善凝胶图片?

  ——凝胶图片处理与文件分析系统

  如果你确实真正思考过,那么就会意识到数据其实只不过是针对不同points获得,测定和比较的能力——当然这些对于观察也许意义重大。在科学研究的历史长河里,要想获得分析结果,大部分都需要通过一系列films或者其它形式的数据,进行了并列比较和解释才能得到,也就是说,真正定量的值本质上而言,很大一部分很少是只通过特殊的条带和点获得的,因此我们需要大量的数据,以及对数据的分析比较。

  生物技术操作手段发展至今,电子和成像技术的应用成熟,为我们收集数据带来了许多便利,实验室已经能够自如收集这些数据,对这些冷冰冰的数字进行分析比较,得出更加精确的预测结果。而且目前的硬件设施收集到的信息来源范围也是空前的——从荧光检测标记,到比色法(colorimetric assays),再到放射自显影(autoradiograms)黑白图片中都能收集到各种数据。

  随着成像捕捉设备的进步,计算机和软件也拓展了分析功能的范围。利用计算机软件修正凝胶图像,更准确的估算分子量;消除背景,提供更准确的条带数量估计,所有的这些都使得凝胶成像系统更趋于物美价廉。

  目前有关凝胶成像系统的生产厂家和产品数量都有明显的增加,用户可以根据各自的预算、图片数据的性质、对基本成像还是侧重于定量分析功能的偏好来选择凝胶成像系统。

  在商业的凝胶成像分析系统中,你可能会遇到两种基本的电子成像硬件格式。这两种格式都各自具有自身的优点,可以根据实验室全面的需要进行考虑。一种是照相机型成像系统,这种系统提供了一种收集各种范围的图像的方法,从溴化乙锭染色凝胶,到标准的自显影、实时的捕捉化学发光;另一种是专门用于干燥、平整的凝胶形式的扫描仪。

  其中也许最常见的照相系统要数CCD (charge-coupled device)相机了。这些照相机,通常与一种光源(白光或者紫外光)设备联用。传统的成像只需捕捉影像功能就行,几乎所有的系统都能达到这种功能。更敏感的系统能够在不需要光源的情况下成像,比如,捕捉化学发光。这些应用中,硬件的灵敏度是很突出的问题,照相机的灵敏度的测量单位为lux,照相机低lux能很好地收集低光发射,因此,被建议用于化学发光成像系统中。

  由芯片控制的CCD照相机成像在给定时间段里的不连续的电荷能通过芯片转换成数码信号。这种特性被认为是一种改变曝光程度的重要方法。理论上,整合时间越长,从化学发光物捕捉光的性能就越好。但是随着时间的增加,信噪也增加。但总的来说芯片整合型成像系统更适用于高性能的要求。当然,低lux的相机需要的更少的整合就能有效地采集信号。

  一些相机被描述成“冷”CCD照相机,对于所有的CCD相机而言,信噪是影响分辨能力的一大影响因素,而冷处理减少了背景信噪,然而这种特性是否需要,仍在争议中。

  另外一种需要考虑的特性是相机的分辨率。总的来说,CCD照相机的象素越高,分辨率就越大,同时捕捉的图像信息量就更大,图像文件的大小就更大。

  对于各种不同的应用,照相机需要装备特定的滤光设备来满足不同的工作光波波长的需要。通常这些滤光器装备在装在照相机镜头前。紫外光过滤器,将紫外光分散使得光源不能为照相机“可视”。得考虑实验室的不同需要(SYBR-green, ethidium bromide等) 选择不同的过滤器。

  最后市场上另一种照相机系统是CMOS照相机,这是一种更为便宜的系统,但是灵敏度没有CCD高。因此CMOS照相机的信噪比较高。此外,CMOS照相机不像CCD相机一样整合起来。

  除了相机之外,还有另外的图像捕捉方法。扫描仪就是其中的一种。扫描仪的价格要比CCD相机系统便宜得多。许多扫描仪是桌面式的,可以容纳大图片。此外还有一些加了对比度调节硬件的扫描仪。这个特性能优化获得的图像,而不仅仅依赖于软件的调整。

  从透视性能来说,与相机相比,扫描仪需要一种更强的照明光源。有点像感光剂成像像机。一种好的扫描仪,可以提供0.01-0.3OD宽阔,线性动态范围。扫描仪具有高分辨率的特性,可以达到1200dpi。扫描仪的一个瓶颈问题是,不能对溴化乙啶凝胶进行成像。

以下我们来看一些凝胶成像产品:

Advanced American Biotechnology (AAB)
Gel Documentation System and Gel Doc I
来自AAB的该成像系统由一台奔腾处理器的计算机、时间整合视频相机、动态镜头、紫外过滤器,暗室、双重透射器和用于成像获取分析的软将构成。Gel Doc I系统具有一个0.03视频照相机,镜头、紫外滤器、暗室和图像打印机组成。AAB公司同时推出了各种软件以满足不同的成像需要。(www.members.aol.com/aabsoft)

Alpha Innotech
AlphaImagerTM, ChemiImagerTM, AlphaScanTM, and AlphaDocTM Digital Imaging Systems
来自Alpha Innotech 集团的AlphaImagerTM imaging系统,具有一个non-vineatting镜头,荧光滤器、计算机、和AlphaEaseTM图像软件。ChemiImagerTM利用了一种独创的3阶段热电冷处理CCD。能够实时捕捉,是白光、荧光和低光应用的理想产品。广泛应用于凝胶、底片、薄膜,平板和化学发光样品的成像中。所有系统均安装了AlphaEaseTM软件。

Ana-Gen Technologies ImageDOC System
Ana-Gen's ImageDoc系统是一种入门系统。这种基础的系统由一个高分辨率的手动调焦的CCD相机、一个高分辨率的单色显示器,一个256色灰白打印机、暗室、和一个紫外光透射器组成。该系统可以改装也可以升级。9寸的显示器使得用户能预览实时的图像。可以根据需要选用其他的一些配件,如动态镜头等。

Bio Image
GelPrint 1000i, GelPrint 2000i, GelPrint Plus, and GelPrint Ultra
BioImage公司提供了广泛应用于成像分析的系统。GelPrint 1000i系统具有一个镜头固定聚焦的CCD照相机,256色灰白打印机,是一个专业的凝胶成像系统。不同的是,GelPrint 2000i系统具有一个动态的镜头。GelPrint Plus 和GelPrint Ultra不需要计算机平台,附带了一台600dpi l的激光打印机,暗室,和综合软件包。GelPrint Plu具有一个8-bit的动态镜头冷照相机。

Biometra
BioDoc I and BioDoc II Video DocumentationSystems
来自Biometra公司的这两种系统具有一个整合在芯片上的CCD照相机。简便的BioDoc I能通过图像热打印机进行成像。最新的BioDoc II运用了一格软键盘,能整合进一个局域网内。同时推出了各种凝胶分析的软件。

Bio-Rad
Gel Doc 1000, Insta Doc I and Insta Doc II 
Bio-Rad公司提供了一系列的凝胶成像系统。Insta Doc I是最开始的产品。Insta Doc II包括一个完全暗室和一个光透射器。Gel Doc 1000是一个完全用于分析凝胶带型、体积和分子量的系统。所有的系统都运用了一台8-bit的高分辨率CCD照相机,并随时能升级。Bio-Rad公司也提供了一系列的RFLP, 2D和DNA sequencing软件(https://www.bio-rad.com/)

Eastman Kodak Company
Kodak Digital Science EDAS 120 System and BandScanner 1D System
来自Eastman Kodak公司的EDAS 120系统具有DC120动态数码照相机。该照相机具有自动/手动闪光、光圈和快门速度控制、和一个LCD预览屏幕组成。BandScanner 1D利用600 dpi Hewlett Packard Scanjet 6100数码记录图像。两种体统均安装了Kodak Digital Science 1D 图像分析软件。https://www.kodak.com/

FOTODYNE
FOTO/Analyst MiniVisionary, Visionary Eclipse, Archiver Eclipse, and Investigator Eclipse Systems
FOTODYNE公司提供了广泛的凝胶成像分析系统。MiniVisionary Apprentice和Visionary系统提供了简便电子成像方式。Archiver 系统能将四张图片储存于软盘中。Investigator是FOTODYNE最强大的电子成像体统。

Lightools Research
Speedlight Jr. GDS, Speedlight GDS, and Speedlight Platinum GDS
Lightools Research公司的Speedlight系统的操作是独立而不需要计算机。该系统基于CCD照相机和一个256色的灰白打印机组成。Speedlight Platinum主要用于数据的收集和数据的分散分析。

NucleoTech Corporation
NucleoVisionTM 420, 530, 760, 830, and 920 Systems
NucleoTech公司提供了大量的凝胶成像系统,包括紧凑的“documentation systems”系统。用于图像处理,归档、和分析,和普通的系统。系统利用PC平台或者Macintosh平台。GelExpert软件与32-bit的程序兼容,可用于Windows 95/NT 4.0 o或者Macintosh系统。https://www.nucleotech.com/

Pharmacia Biotech ImageMaster VDS
ImageMaster VDS是一个自包型独立成像系统,具有一个数码图像CCD,能在芯片水平上整合信号。该系统和ImageMaster一样包括了一个动态的镜头,过滤器、显示器、光透射器、紫外光滤器,和一台打印机。ImageMaster不需要PC进行控制,能在两秒内探测到20 picograms的溴化乙啶染色的琼脂糖凝胶和丙烯酰胺凝胶的DNA条带。https://www.biotech.pharmacia.se/

Scanalytics
DocuGel Workstation, BenchTop I Scanner, and BenchTop II Scanning Densitometer
DocuGel Gel 成像工作站整合了具有动态镜头的CCD相机,一个可选的Sony 256色灰白打印机,可以在Macintosh或者PC机上进行操作。BenchTop I是一个12bit的扫描仪[optical density (O.D.)( 0 -2.4)], BenchTop II(O.D. 0 -3.0.) . BenchTop I可以处理8.5 x 14"彩色或则黑白的图像,BenchTop II可以处理高达14 x 17".的图像。https://www.scanalytics.com/

Stratagene
Eagle Eye II Still Video System
通过在化学发光方面的改进,Eagle Eye II是一个全能的凝胶成像系统。由 一个暗箱,高分辨率CCD,动态镜头,打印机,奔腾计算机和采色显示器组成。Eagle Eye II可以采集几乎所有类型的图片数据,从溴化乙啶染色到Syber¨-, Sypro¨-,和silver染色凝胶,甚至色谱板。具有许多可供选择的硬件设备。

Ultra-Lum
Ultra-Imager-5000, Big-Gel-Imager-4500, and KS-4000-Slide-Imager
Ultra-Lum公司的light-tight系统运用了一个专利未决的Ultra-GloTM UV-to-Visible Light Converter,一个高分辨率的CCD照相机。自动动态镜头,256色灰白打印机,Image-PC软件,可以运用于Pentium 或者PowerMac计算机。Ultra-Imager-5000具有一个小型光密封性暗箱。KS-4000-Slide-Imager具有照相机幻灯片伯凡功能。Gel-Imager-4500使用与工作台上浏览高达20 x 40 cm的图片/。https://www.ultralum.com/

UVP
GDS-8000, 7600, 7500, and PhotoDOC-It Systems
GDS-8000是一台基于PC系统能进行同位置进行采集和分析的系统。GDS-7600与GDS-8000相近是一个基于Macintosh的系统。GDS-7500伴随着ImageStoreTM处理单位,有捕捉卡和软件完成。UVP同样也提供了精确的图像分析软件。https://www.uvp.com/

VILBER LOURMAT Photo-Print System
Photo-Print系统的核心是一个具有动态镜头的CCD相机。使得在不改变镜头得条件下拍摄到长度为2-25cm的凝胶图片。Photo-Print的前端控制板提供了简单的实时预览选择。可以在Windows 3.1 or 95下应用。
(生物通:亚历)

顶风作品 QQ:50443527 TEL:13701010924 E-Mail:leehp@sohu.com http://www.yeec.com

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gaojc 发表于 2013-6-16 10:42 | 显示全部楼层
路过,学习。
qlc100 发表于 2020-2-21 20:07 来自手机 | 显示全部楼层
学习了,感谢分享
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