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SARS的病原及全基因序列[转帖]

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郑振寰 发表于 2003-7-16 11:00 | 显示全部楼层 |阅读模式

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SARS的病原及全基因序列 -------------------------------------------------------------------------------- 作者:coolautumn   SARS是一种新的急性传染性疾病,病原、传播以及成因都是未知数。自发现SARS以来,医务工作都就紧张的寻找病原。刚开始所有非典型肺炎的病原(军团菌、衣原体、微球菌以及病毒等)都曾被怀疑,军团菌、微球菌逐渐被排除。从香港、中国大陆以及加拿大等地实验室陆续从患者体内检测出人类间质肺病毒(metapneumovirus, paramyxoviridae副黏液病毒科)、衣原体以及冠状病毒(coronavirus)。对于SARS的病原一时众说纷纭。   最近,德国、加拿大、美国科学家使用更多方法检验了以上三种病原的可能性,最终确认一种新的冠状病毒与SARS密切相关,推测它是致病的元凶。最权威的临床学术刊物《新英格兰杂志》于十日刊登了最新研究成果,各国科学家拿出的结果惊人的相似,近似于100%的相同,在对新病毒测序中,全长30000个碱基只有100多不同,显示目前病毒以很稳定的存在环境中。   近日中国科学院院士洪涛也认同新的冠状病毒是致病元凶。但同时坚持SARS是多病原体引起的,衣原体也是其中重要的一种。   病毒发现历程:   首先各自收集亚洲地区为主的SARS检体样本进行已知的病源测试,在这一部份大多数的检体都呈现阴性,显示这是由新的病源所引起。   接着他们将病源进行的活体外培养,美国科学家使用了芯片技术与所有病毒进行杂交,发现与冠状病毒最近,而以后的测序也验证了这一点。这个结论与德、加等国的研究成果完全一致。   新病毒的特点:   冠状病毒的出现最令科学家惊讶,因为依据过去的了解冠状病毒对人造成危害的例子不多,唯一与呼吸道疾病有关的症状并不像SARS这么严重,而且基因序列也有极大的差异。国际SARS研究团队在发现新种冠状病毒之后,旋即以血清学分析、免疫组织染色、PCR等方法检查手中现有的检体,在18个检体中果真有一种以上的方法呈现阳性,证实新种冠状病毒与SARS的相关。另外德国科学家则是实时定量PCR的方法(real-time PCR)来侦测病毒的存在与数目,经过试验可以区分冠状病毒在SARS可能患者与健康对照的有无。   病毒来源:   依据新种冠状病毒与已知冠状病毒的演化树分布,SARS-冠状病毒应该是变种而来,如果能了解病毒的来源,或许就能更了解新种冠状病毒的传染机制与传播途径。另外,依据柯霍氏法则(Koch's postulates),在SARS患者上发现冠状病毒的存在仅能说明两者有关系,但未必就确定新种冠状病毒就是元凶,研究团队还需要更多的实验才能确认新种冠状病毒是SARS的病源。   荷兰Utrecht大学的Peter Rottier说。Rottier的研究小组通过向猫细胞导入传染性猫腹脑炎病毒(feline infectious peritonitis virus,FIPV)创造出这种新冠状病毒。FIPV是一种常见病原体,5%的猫都是死于该病毒。研究人员给FIPV导入小鼠冠状病毒的一个基因片段,该基因编码一种外壳蛋白可以识别并帮助穿透小鼠细胞。 几个小时后,猫FIPV病毒的一些病毒粒子的外壳蛋白基因变成了小鼠的外壳基因,因而可以感染小鼠细胞了。如果两种蛋白同时感染同一细胞就可能发生这种情况。 这个结果支持了SARS冠状病毒可能是在动物和人类病毒相遇,发生基因交换时产生的观点,也提示了病源来源于动物的可能。同时这项研究也证明了一个同怕的问题:冠状病毒通过基因改变能够轻易地改变感染宿主。   由于冠状病毒能够很容易的与动物或其它病毒发生基因转移性重组,因此理论上生物恐怖分子可以利用这一技术制造出危害性更大的新病源。但科技总是双刃剑,利用这一技术也可以制造出保护性疫苗。Rottier的研究小组已开始研制抗冠状病毒的活疫苗。他们筛选了感染小鼠的FIPV中由于基因交换变为无毒的病毒株。他们发现,用这些病毒株中的一种结种猫,可以防止猫感染上原始的致命FIPV。   最新检测方法:   病毒的基因序列已经确定,所以RT-PCR是检测病毒最快的也是最好的方法。德国汉堡的一家公司已经开发出该病毒的实时荧光定量检测试剂。   附,基因序列 1 atattaggtt tttacctacc caggaaaagc caaccaacct cgatctcttg tagatctgtt 61 ctctaaacga actttaaaat ctgtgtagct gtcgctcggc tgcatgccta gtgcacctac 121 gcagtataaa caataataaa ttttactgtc gttgacaaga 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