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郑振寰 发表于 2006-8-31 19:42 | 显示全部楼层 |阅读模式

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Gram-negative bacilli 革兰阴性杆菌 Synonym/Taxonomic posotion 曾用名/分类
Bacteroidaceae 拟杆菌科    
Bacteroides fragile group 脆弱拟杆菌组 true Bacteroides  
Bacteroides caccae 粪拟杆菌 Bacteroides fragile group 3452A 脆弱拟杆菌组3452A
Bacteroides distasonis 吉氏拟杆菌 Related to Porphyromonas species 与卟啉单胞菌属相关
Bacteroides eggerthii 埃氏拟杆菌    
Bacteroides fragilis 脆弱拟杆菌    
Bacteroides merdae 屎拟杆菌 Bacteroides fragilis T4-1 脆弱拟杆菌T4-1
Bacteroides ovatus 卵形拟杆菌    
Bacteroides stercoris 粪便拟杆菌 Bacteroides fragilis subspecies a 脆弱拟杆菌亚种a
Bacteroides thetaiotaomicron 多形拟杆菌    
Bacteroides uniformis 单形拟杆菌    
Bacteroides vulgatus 普通拟杆菌    
Bacteroides speciesother 其他拟杆菌 Taxonomic position of the non-  
    Bacteroides fragilis group  
    Bacteroides remains uncertain  
Bacteroides capillosus 多毛拟杆菌    
Bacteroides coagulans 凝固拟杆菌    
Bacteroides forsythus 福赛斯尼杆菌 Related to Porphyromonas species 与卟啉单胞菌属相关
Bacteroides putredinis 腐败拟杆菌 Possibly related to Rikenella 很可能与理研菌属有关
Bacteroides pyogenes* 化脓拟杆菌 Bacteroides tectum homology 隐蔽拟杆菌
    cluster II (some strain)  
Bacteroides splanchnicus 内脏拟杆菌 Possibly represent anew genus  
Bacteroides tectus* 隐藏拟杆菌 Bacteroides tectusrelated to  
    Bacteroides fragile group 与脆弱拟杆菌组相关
Bacteroides ureolyticus 解脲拟杆菌 Bacteroides corrodensrelated to 啮蚀拟杆菌
    Campylobacter 与弯曲杆菌属相关
Fusobacterium 梭杆菌属    
Fusobacterium alocis 龈沟梭杆菌    
Fusobacterium gonidiaformans 微生子梭杆菌    
Fusobacterium mortiferum 死亡梭杆菌    
Fusobacterium naviforme 舟形梭杆菌    
Fusobacterium necrogenes 坏疽梭杆菌    
Fusobacterium necrophorum 坏死梭杆菌    
Fusobacterium necrophorum 坏死梭杆菌    
ssp. funduliforme 基形亚种    
Fusobacterium necrophorum 坏死梭杆菌    
ssp. necrophorum 坏死亚种    
Fusobacterium nucleatum 具核梭杆菌    
Fusobacterium nucleatum ssp 具核梭杆菌    
fusiforme 梭形亚种    
Fusobacterium nucleatum ssp 具核梭杆菌    
nucleatum 具核亚种    
Fusobacterium nucleatum ssp 具核梭杆菌    
polymorphum 多形亚种    
Fusobacterium nucleatum ssp 具核梭杆菌    
vicentii 文氏亚种    
Fusobacterium periodonticum 牙周梭杆菌 Related to Fusobacterium nucleatum 与具核梭杆菌相关
Fusobacterium russii 拉氏梭杆菌    
Fusobacterium ulcerans 溃疡梭杆菌    
Fusobacterium varium 可变梭杆菌 Fusobacterium pseudonecrophorum 假坏死梭杆菌
Porphyromonas 卟啉单胞菌属    
Porphyromonas asaccharolytica 不解糖卟啉单胞菌 Bacteroides asaccharolytica 不解糖拟杆菌
    Bacteroides melaninogenicus  
    ssp. asaccharolytica  
Porphyromonas cangingivalis* 犬齿龈液卟啉单胞菌    
Porphyromonas canoris* 犬嘴卟啉单胞菌    
Porphyromonas cansulci* 犬口腔卟啉单胞菌    
Porphyromonas catoniae   Oribaculum catoniae 卡氏口腔杆菌
Porphyromonas circumdentaria* 牙周卟啉单胞菌    
Porphyromonas crevioricanis* 狗口腔卟啉单胞菌    
Porphyromonas endodontalis 牙髓卟啉单胞菌 Bacteroides endodontalis 牙髓拟杆菌
Porphyromonas gingivalis 牙龈卟啉单胞菌 Bacteroides gingivalis 牙龈拟杆菌
Porphyromonas gingivicanis* 狗齿龈卟啉单胞菌    
Porphyromonas levii* 利氏卟啉单胞菌 Bacteroides levii* 利氏拟杆菌
    Bacteroides melaninogenicus ssp. levii*  
Porphyromonas macacae 猕猴卟啉单胞菌 Bacteroides macacae 猕猴拟杆菌
    Porphyromonas salivasa 唾液卟啉单胞菌
Prevotella 普雷沃氏菌属    
Prevotella bivia 二路普雷沃氏菌 Bacteroides bivius 二路拟杆菌
Prevotella buccae 颊普雷沃氏菌 Bacteroides buccae 颊拟杆菌
    Bacteroides ruminicola ssp.brevis 栖胃瘤拟杆菌短亚种
    Bacteroides capillus  
    Bacteroides pentosaceus 戊糖拟杆菌
Prevotella buccalis 口颊普雷沃氏菌 Bacteroides buccalis 口颊拟杆菌
Prevotella corporis 人体普雷沃氏菌 Bacteroides corporis 人体拟杆菌
Prevotella dentalis   Bacteroides dentalis  
    Hallella seregens 需血清霍氏菌
Prevotella denticola 栖牙普雷沃氏菌 Bacteroides denticola 栖牙拟杆菌
Prevotella disiens 解糖胨普雷沃氏菌 Bacteroides disiens 解糖胨拟杆菌
Prevotella enoeca 抑制普雷沃氏菌    
Prevotella heparinolytica 解肝素普雷沃氏菌 Bacteroides heparinolyticus 解肝素拟杆菌
    Related to Bacteroides fragilis group 与脆弱拟杆菌组相关
Prevotella intermedia 中间普雷沃氏菌 Bacteroides intermedius 中间拟杆菌
    Bacteroides melaninogenicus ssp.intermedius  
Prevotella loescheii 洛氏普雷沃氏菌 Bacteroides loescheii 洛氏拟杆菌
Prevotella melaninogencia 产黑色素普雷沃氏菌 Bacteroides melaninogenicus ssp. 产黑色素拟杆菌
    melaninogenicus 产黑色素亚种
Prevotella nigrescens 变黑普雷沃氏菌 Prevotella intermedia(some strains) 中间普雷沃氏菌
Prevotella oralis 口腔普雷沃氏菌 Bacteroides oralis 口腔拟杆菌
Prevotella oris 口普雷沃氏菌 Bacteroides oris 口腔拟杆菌
    Bacteroides ruminicola ssp.brevis 栖胃瘤拟杆菌短亚种
Prevotella oulorum 龈炎普雷沃氏菌 Bacteroides oulorum 龈炎拟杆菌
    Prevotella oulora 龈炎普雷沃氏菌
Prevotella pallens   New species  
Prevotella tannerae 谭氏普雷沃氏菌   坦纳氏普雷沃氏菌
Prevotella veroralis 真口腔普雷沃氏菌 Bacteroides veroralis 真口拟杆菌
Prevotella zoogleoformans 动胶普雷沃氏菌 Bacteroides zoogleoformans 动胶拟杆菌
    Related to Bacteroides fragilis group 与脆弱拟杆菌组相关
Other Bacteroidaceae genera 其他拟杆菌    
Anaerobiospirillum succiniciproducens 产琥珀酸厌氧螺菌    
Anaerobiospirillum thomasii   New species  
Anaerobiospirillum furcosus 叉状厌氧螺菌 Bacteroides furcosus 叉状拟杆菌
    Related to Porphyromonas species 与卟啉单胞菌属有关
Bilophila wadsworthia 沃氏嗜胆菌    
Butyrivibrio fibrisolvens 溶纤维丁酸弧菌 Related to Clostridium subphylum cluster XIVa  
Calonella morbi   Related to Clostridium subphylum cluster XIVa  
Centipeda periodontii 牙周蜈蚣菌 Related to Selenomonas species 与月形单胞菌属有关
Dialister pneumosintes   Bacteroides pneumosintes, related to Sporomusa 侵肺拟杆菌
    branch of Clostridium subphylum cluster IX  
Dichelobacter nodosus* 节瘤偶蹄形菌 Bacteroides nodosus 节瘤拟杆菌
Johnsonella ignava 懒惰约翰森氏菌 Related to Clostridium subphylum cluster XIVa  
Leptotrichia buccalis      
Leptotrichia sanguinegens      
Mitsuokella mutacida 多酸光岗菌 Mitsuokella mutiacida 多酸光岗菌
    Bacteroides mutiacidus, related to Sporomusa 多酸拟杆菌
    branch of Clostridium subphylum cluster IX  
Selenomonas 月形单胞菌属 Related to Sporomusa branch of  
    Clostridium subphylum cluster IX  
Selenomonas artemidis 蛛形月单胞菌    
Selenomonas dianae 月神月单胞菌    
Selenomonas flueggei 福氏月单胞菌    
Selenomonas infelix 有害月单胞菌   不幸月单胞菌
Selenomonas noxia 有害月单胞菌    
Selenomonas sputigena 生痰月单胞菌    
Sutterella wadsworthensis      
Tissierella praeacuta 极尖组织菌 Bacteroides praeacuta 极尖拟杆菌
    Related to Clostridium subphylum cluster XII  
Campylobacteraceae 弯曲杆菌科    
Campylobacter concisus 简明弯曲杆菌    
Campylobacter curvus 曲形弯曲杆菌 Wolinella curva 曲形沃林氏菌
Campylobacter gracilis 纤细弯曲杆菌 Bacteroides gracilis (some strains) 纤细拟杆菌
Campylobacter rectus 直肠弯曲杆菌 Wolinella recta 直肠沃林氏菌
Campylobacter showae 昭和弯曲杆菌    
Campylobacter sputorum 唾液弯曲杆菌    
Dissimilatory sulphate-or      
sulphur-reducing bacteria      
Desufomonas pigra      
Desufovibrio desulfuricans      
       
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 楼主| 郑振寰 发表于 2006-8-31 19:43 | 显示全部楼层
Gram-negative cocci 革兰阴性球菌    
Veilonellaceae 韦荣球菌科 Related to Sporomusa branch of  
    Clostridium subphylum cluster IX  
Acidaminococcus fermentans 发酵氨基酸球菌    
Megasphaera elsdenii 埃及巨球菌    
Veillonella dispar 殊异韦荣球菌    
Veillonella parvula 小韦荣球菌    
       
Non-spore-forming Gram positive bacilli 无芽孢革兰阳性杆菌    
Actinobaculum      
Actinobaculum schaalii   New genus and species, Actinomyces-like  
Actinomyces 放线菌属    
Actinomyces europaeus   New species  
Actinomyces georgiae 乔氏放线菌 Actinomyces D08 放线菌D08
Actinomyces gerencseriae 戈氏放线菌 Actinomyces israelii serotype II 衣氏放线菌血清型II
Actinomyces graevenitzii   New species  
Actinomyces israelii 衣氏放线菌    
Actinomyces meyeri 麦尔放线菌    
Actinomyces naeslundii 内氏放线菌 Possibly homologous with Actinomyces viscosus 很可能与粘放线菌同源
Actinomyces neuii 纽氏放线菌 CDC corynform group 1  
Actinomyces neuii ssp.anitratus 纽氏放线菌无硝亚种    
Actinomyces neuii ssp.neuii 纽氏放线菌纽氏亚种    
Actinomyces odontolyticus 龋齿放线菌    
Actinomyces radingae   CDC corynform group E,APL1  
Actinomyces turicensis 图列茨放线菌 CDC corynform group E,APL10  
Actinomyces viscosus 粘放线菌 Possibly homologous with Actinomyces naeslundii 很可能与内氏放线菌同源
Arcanobacterium 隐秘杆菌属    
Arcanobacterium bernardiae 伯尔德氏隐秘杆菌 Actinomyces bernardiae 伯尔德氏放线菌
    CDC corynform group 2  
Arcanobacterium pyogenes 化脓隐秘杆菌 Actinomyces pyogenes 化脓放线菌
    Corynebacterium pyogenes 化脓棒杆菌
Atopobium 阿托波氏菌属    
Atopobium minutum 小阿托波氏菌 Lactobacillus minutus 小乳杆菌
Atopobium parvulum 极小阿托波氏菌 Streptococcus parvulus 极小链球菌
    Peptostreptococcus parvulus 极小消化链球菌
Atopobium rimae 裂阿托波氏菌 Lactobacillus rimae 裂乳杆菌
Bifidobacterium 双歧杆菌属    
Bifidobacterium adolescentis 青春双歧杆菌    
Bifidobacterium angulatum 角双歧杆菌    
Bifidobacterium bifidum 双歧双歧杆菌    
Bifidobacterium breve 短双歧杆菌    
Bifidobacterium catenulatum 链状双歧杆菌    
Bifidobacterium denticolens   New species,Bifidobacterium dentium (some strains) 齿双歧杆菌
Bifidobacterium dentium 齿双歧杆菌 Bifiobacterium appendicitis 阑尾炎双歧杆菌
    Bifiobacterium eriksonii 埃氏双歧杆菌
Bifidobacterium infantis 婴儿双歧杆菌    
Bifidobacterium inopinatum   New species,Bifidobacterium dentium (some strains) 齿双歧杆菌
Bifidobacterium longum 长双歧杆菌    
Bifidobacterium pseodocatenulatum 假小链状双歧杆菌    
Collinesella   New genus  
Collinesella aerofaciens   Eubacterium aerofaciens 产气真杆菌
Eggerthella   New genus  
Eggerthella lenta   Eubacterium lentum 迟缓真杆菌
Eubactrium 真杆菌属    
Eubacterium brachy 短真杆菌    
Eubacterium combesii 孔氏真杆菌    
Eubacterium contortum 扭曲真杆菌    
Eubacterium infirmum      
Eubacterium limosum 粘液真杆菌    
Eubacterium minutum 细小真杆菌 Eubacter tardum  
Eubacterium moniliforme 念珠状真杆菌    
Eubacterium nitriogenes 产亚硝酸真杆菌    
Eubacterium nodatum 缠结真杆菌    
Eubacterium saburreum 砂真杆菌    
Eubacterium saphenum 隐藏真杆菌    
Eubacterium tenue 纤细真杆菌 Related to Clostridium species 与梭菌属相关
Eubacterium timidum 胆怯真杆菌    
Eubacterium yurii 尤氏真杆菌    
Eubacterium yurii ssp.yurii 尤氏真杆菌尤氏亚种    
Eubacterium yurii ssp.margaretiae 尤氏真杆菌珍珠亚种    
Eubacterium yurii ssp.schtitka 尤氏真杆菌舒蒂卡亚种    
Lactobacillus 乳杆菌属    
Lactobacillus acidophilus 嗜酸乳杆菌    
Lactobacillus brevis 短乳杆菌    
Lactobacillus casei 干酪乳杆菌    
Lactobacillus catenaforme 链状乳杆菌    
Lactobacillus crispatus 卷曲乳杆菌    
Lactobacillus fermentum 发酵乳杆菌    
Lactobacillus gasseri 加氏乳杆菌    
Lactobacillus iners   New species  
Lactobacillus jensenii 詹氏乳杆菌    
Lactobacillus leichmannii 德氏乳杆菌    
Lactobacillus oris 口乳杆菌    
Lactobacillus paracasei ssp.paracasei 类干酪乳杆菌类干酪亚种    
Lactobacillus paraplantarum      
Lactobacillus plantarum 植物乳杆菌    
Lactobacillus rhamnosus 鼠李糖乳杆菌 Lactobacillus GG (some strains) 乳杆菌GG
Lactobacillus salivarius 唾液乳杆菌    
Lactobacillus uli 齿龈乳杆菌    
Lactobacillus vaginalis 阴道乳杆菌    
Hodemania   New genus  
Hodemania filiformis      
Mobiluncus 动弯杆菌属    
Mobiluncus curtisii 柯氏动弯曲菌 Two subspecies phylogenetically represent one species  
Mobiluncus curtisii ssp.curtisii 柯氏动弯杆菌柯氏亚种    
Mobiluncus curtisii ssp.holmesii 柯氏动弯杆菌霍氏亚种    
Mobiluncus mulieris 羞怯动弯杆菌    
Propionibacterium 丙酸杆菌属    
Propionibacterium acnes 疮疱丙酸杆菌    
Propionibacterium avidum 贪婪丙酸杆菌    
Propionibacterium granulosum 颗粒丙酸杆菌    
Propionibacterium lymphophilum 嗜淋巴丙酸杆菌    
Propionibacterium propionicus 丙酸丙酸杆菌 Propionibacterium propionicum 丙酸丙酸杆菌
    Arachinia propionica 丙酸蛛菌
    Actinomyces propionicua 丙酸放线菌
Pseudoramibacter      
Pseudoramibacter alactolyticus   Eubacterium alactolyticus 不解乳真杆菌
Slackia   New genus  
Slackia exigua   Eubacterium exigua  
Slackia heliotrinireducens   Peptostreptococcus heliotrinireducens 还原天芥菜碱消化链球菌
Clostidium 梭菌属   梭状芽孢杆菌属
Clostidium absonum 不同梭菌    
Clostidium argentinense 阿根廷梭菌 Clostidium botulinum group G 肉毒梭菌G
    Clostidium subterninale (some strains) 近端梭菌
    Clostidium hastiforme (some strains) 矛形梭菌
Clostidium baratii 巴氏梭菌 Clostridium baratii 霸氏梭菌
    Clostidium paraperfringens 类产气荚膜梭菌
    Clostidium perenne 多年生梭菌
Clostidium beijerinckii 拜氏梭菌    
Clostidium bifermentans 双酶梭菌    
Clostidium botulinum 肉毒梭菌 Clostridium putrificum 腐败梭菌
Clostidium butyricum   Clostridium pseudobacterium  
Clostidium cadaveris 尸毒梭菌    
Clostidium carnis 肉梭菌    
Clostidium celatum 隐藏梭菌    
Clostidium clostridioforme 梭状梭菌 Clostidium clostridiiforme 梭状梭菌
Clostidium coccoides 球形梭菌    
Clostidium cochlearium 匙形梭菌 Clostridium lentoputrescens 缓腐梭菌
Clostidium cocleatum 耳蜗形梭菌    
Clostidium difficile 艰难梭菌 Clostidium difficilis 艰难梭菌
Clostidium fallax 诡诈梭菌 Clostridium pseudofallax 类诡诈梭菌
Clostidium ghonii 戈氏梭菌 Clostidium ghoni 戈氏梭菌
Clostidium glycolicum 乙二醇梭菌    
Clostidium haemolyticum 溶血梭菌 Clostridium novyi type D 诺氏梭菌D
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Clostidium hastiforme 矛形梭菌    
Clostidium histolyticum 溶组织梭菌    
Clostidium indolis 吲哚梭菌    
Clostidium innocuum 无害梭菌    
Clostidium irregulare 不规则梭菌 Clostridium irregularis 不规则梭菌
Clostidium limosum 泥渣梭菌 Clostridium species CDC group P-1  
Clostidium leptum 柔嫩梭菌    
Clostidium malenominatum 坏名梭菌    
Clostidium novyi 诺氏梭菌    
Clostidium oroticum 乳清酸梭菌 Zymobacterium oroticum 乳清酸发酵杆菌
Clostidium paraputrificum 类腐败梭菌    
Clostidium perfringens 产气荚膜梭菌 Clostridium welchii 韦氏梭菌
    Welchia perfringens 产气荚膜韦尔奇氏菌
    Gas bacillus  
Clostidium piliforme* 毛状梭菌 Bacillus piliformis 毛状芽孢杆菌
    Tyzzer's bacillus  
Clostidium putrefaciens 腐化梭菌    
Clostidium ramosum 多枝梭菌 Eubacterium filamentosum 细丝真杆菌
    Ramibacterium ramosum 多枝枝杆菌
    Actinomyces ramosum 多枝放线菌
    Eubacterium ramosum 多枝真杆菌
Clostidium septicum 败毒梭菌    
Clostidium sordellii 索氏梭菌   污泥梭状芽孢杆菌
Clostidium sphenoides 楔形梭菌    
Clostidium sporogenes 生孢梭菌 Nontoxigenic strains of Clostidium botulinum  
Clostidium subterninale 近端梭菌    
Clostidium symbiosum 共生梭菌 Fusobacterium symbiosum 共生梭杆菌
    Fusobacterium biacutus 双尖梭杆菌
    Bacteroides symbiosus 共生拟杆菌
Clostidium tertium 第三梭菌    
Clostidium tetani 破伤风梭菌    
Filifactor villosus* 绒毛产线菌 Clostridium villosum 绒毛梭菌
       
Gram-positive cocci 革兰阳性球菌    
Gemella morbillorum 麻疹孪生球菌 Strptococcus morbillorum 麻疹链球菌
Peptococcus niger 黑色消化球菌 Micrococcus niger 黑色微球菌
Peptostreptococcus 消化链球菌属 Includes many species that were formely Peptococcus  
Peptostreptococcus anaerobius 厌氧消化链球菌    
Peptostreptococcus asaccharolyticus 不解糖消化链球菌 Peptococcus asaccharolyticus 不解糖消化球菌
Peptostreptococcus harei   New species  
Peptostreptococcus hydrogenalis 氢消化链球菌    
Peptostreptococcus ivorii   New species  
Peptostreptococcus indolicus 产吲哚消化链球菌 Peptococcus indolicus 产吲哚消化球菌
Peptostreptococcus lacrimalis 人眼消化链球菌    
Peptostreptococcus lactolyticus 解乳消化链球菌    
Peptostreptococcus magnus 大消化链球菌 Peptococcus magnus 大消化球菌
    Peptococcus variabilis 可变消化球菌
Peptostreptococcus micros 微小消化链球菌    
Peptostreptococcus octavius   New species  
Peptostreptococcus prevotii 普氏消化链球菌 Peptococcus prevotii 普氏消化球菌
Peptostreptococcus tetradius 四联消化链球菌 Gaffkya anaerobia 嫌气加夫基氏菌
"Peptostreptococcus trisimilis"   Provisional new species  
Peptostreptococcus vaginalis 阴道消化链球菌    
Ruminococcus 瘤胃球菌属   胃球菌属
Ruminococcus hansenii 汉氏瘤胃球菌 Streptococcus hansenii 汉氏链球菌
Ruminococcus productus 产生瘤胃球菌 Peptotreptococcus hansenii 汉氏消化链球菌
Staphylococcus saccharolyticus 非解糖葡萄球菌 Peptococcus saccharolyticus 非解糖消化球菌
Streptococcus 链球菌属    
Streptococcus anginosus 咽峡炎链球菌 Streptococcus anginosus 咽峡炎链球菌
    "Streptococcus milleri" DNA homology group  
Streptococcus constellatus   Streptococcus anginosus 咽峡炎链球菌
    "Streptococcus milleri" DNA homology group  
Streptococcus intermedius 中间链球菌 Streptococcus anginosus 咽峡炎链球菌
    "Streptococcus milleri" DNA homology group  
Streptococcus pleomorphus 多形链球菌 Taxonomic uncertain, related to Clostridium innocuum  
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